Крипта Светог Димитрија налази се у цркви Светог Димитрија. Улаз у крипту се налази поред десног стуба олтара и води до места где је, према предању, Свети Димитрије прво био заточен, где га је затим затекла мученичка смрт, а потом је и сахрањен. То место је заправо источни део великог римског купатила које се налазило у близини форума и стадиона на који су долазиле атлете. Крипта је првобитно служила како би верници из Солуна могли да се поклоне свецу, и да са чесме, из које је текла вода са изворишта које и данас постоји на северном делу цркве, узимају Свету водицу. Након X века, чесма се везује за Миро, које су верници скупљали из њених спремишта посудама од глине, стакла или метала. У Крипти се налази и капела са решеткастим отвором на њеној источној страни. У Крипти је постављена и Изложба с налазима углавном из Базилике и са ископавања вршених на локалитету Крипте.