Die permanente Sammlung des makedonischen Museums für zeitgenössische Kunst besteht aus den wichtigsten Sammlungen von Kunstwerken der jüngeren griechischen Kunst und da sich das Museum dauernd entwickelt, präsentiert es ein dynamisches Gesicht des zeitgenössischen künstlerischen Schaffens, das auf keinen Fall nur einer Ausdrucksform folgt. Nach der wesentlichen Spende von Alexandros Iolas haben auch andere Künstler und Privatpersonen ihre Kunstwerke großzügig angeboten und auf diese Weise zur Vergrößerung dieser Sammlung beigetragen. Ein Teil dieser Sammlung wird seit Dezember 2002 in den neuen Einrichtungen des Museums ausgestellt. Gleichzeitig zu den Sonderausstellungen werden die Kunstwerke der permanenten Sammlung abgewechselt, so dass die Beziehung mit dem Raum, mit dem Publikum und den Künstlern ständig erneuert wird. Heute veranstaltet das Museum außer seiner reichen Ausstellungsaktivität Ausbildungsprogramme, Kurse über die Kunstgeschichte für Erwachsene, Musik- und Theateraufführungen und verfügt über ein Art Shop, ein Café und eine Bibliothek.