Με σκοπό την εξοικείωση των ανθρώπων και ειδικά της νέας γενιάς με τον παραδοσιακό πολιτισμό του πρόσφατου παρελθόντος, οι μόνιμες εκθέσεις του Μουσείου αναφέρονται στις βασικές βιοτικές ανάγκες της διατροφής, της στέγασης και της ένδυσης. Στα 20.000 περίπου αντικείμενα των συλλογών του περιλαμβάνονται λαϊκές φορεσιές, κεντήματα, έργα μικροτεχνίας και ξυλοτεχνίας, μουσικά όργανα, ξύλινα και χάλκινα οικιακά σκεύη, φιγούρες του θεάτρου Σκιών κλπ.
Το Λαογραφικό και Εθνολογικό Μουσείο Μακεδονίας – Θράκης στεγάζεται σε έπαυλη των αρχών του 20ου αιώνα που βρίσκεται στην ανατολική Θεσσαλονίκη, γνωστή ως «Έπαυλη Μοδιάνο», από τον αρχικό ιδιοκτήτη της Ισραηλίτη τραπεζίτη Γιακό Μοδιάνο, ή «Παλαιό Κυβερνείο», από τη χρήση της ως επίσημη κατοικία του Διοικητή Βορείου Ελλάδος κατά τον Μεσοπόλεμο. Η έπαυλη αποτελεί αξιόλογο δείγμα του εκλεκτικισμού της Θεσσαλονίκης, που αναπτύχθηκε στην παραθαλάσσια περιοχή της συνοικίας των «Πύργων» ή «Εξοχών», όπου συνοίκισαν από τα τέλη του 19ου αιώνα εύποροι Θεσσαλονικείς διαφόρων εθνοτήτων.
