Το Εκπαιδευτικό και Πολιτιστικό Ίδρυμα της Ιεράς Μητροπόλεως Νεαπόλεως και Σταυρουπόλεως μεταξύ των αρμοδιοτήτων και των επιδιωκομένων σκοπών του έχει και τη συλλογή, επεξεργασία και μεταλαμπάδευση της γνώσης, για τους ιερούς τόπους της ρωμιοσύνης, τις αλησμόνητες πατρίδες των Ελλήνων. Βασική του επιδίωξη είναι η προτροπή των μαθητών για τη μάθηση της παράδοσης, αλλά και των ιδιαίτερων προγονικών εστιών. Στο Μουσείο προσφυγικού ελληνισμού συλλέχθηκαν, διατηρήθηκαν και παρουσιάζονται Εικόνες αγίων από την Ανατολική Θράκη, τη Βασιλεύουσα Πόλη του Κωνσταντίνου, την Ιωνία, την αγιοτόκο Καππαδοκία, φωτογραφίες παλιές και νέες από την Κωνσταντινούπολη, την Ιωνία, τον Πόντο, την Καππαδοκία, βιβλία, αδιάψευστα ντοκουμέντα του εκπαιδευτικού συστήματος εκεί και τότε, έγγραφα κάθε είδους, ενδυμασίες και διάφορα αντικείμενα καθημερινής χρήσης και προγονικά κειμήλια ιδιαίτερα μεγάλης αξίας.